UPTD Pelabuhan Perikanan Tengkayu II merupakan unit pelaksana teknis pada Dinas Kelautan dan Perikanan Provinsi Kalimantan Utara yang berkedudukan di Kota Tarakan. Pelabuhan ini menjadi sentra kegiatan perikanan tangkap yang melayani aktivitas pendaratan, distribusi, serta pelayanan administratif bagi nelayan dan pelaku usaha perikanan di wilayah Kalimantan Utara.